昭和20年8月6日、二十歳の高丸矢須子（田中好子）は広島に近い疎開先にいた。一瞬輝く強烈な閃光、青空をおおい尽くすキノコ雲。叔父・重松（北村和夫）を頼り市内戻る矢須子の純白のブラウスを、大粒の黒い雨が汚した……
　5年後、美しく成長し適齢期に達した矢須子に次々縁談が持ち込まれる。が、「あの娘はピカを浴びたんじゃ」という噂のためことごとく破談していく。矢須子を預かる身でありながら、嫁がせることのできない重松・シゲ子（市原悦子）夫婦は自責の念にかられるが、かえって矢須子との絆は強まり、実の親子以上の愛情で3人は結ばれるようになる。
　「わしら夫婦と矢須子の三人はピカで結ばれた運命共同体なんじゃ」
　だがそんな彼らの肉体も、”黒い雨”が確実にむしばんでいっているのだった……