物語は第二次世界大戦末期から始まる。海軍での海外赴任から戻った帰還兵のフレディ・クエルは、デパートでのカメラマンとして一般生活に戻っていたが、戦地で患ったアルコール依存を断ち切れず、職場で問題を起こしてしまう。その後も日常生活に適応できず、あてのない放浪の旅に出ていた彼は、あてのない旅に出た彼は、密航した船で＜ザ・コーズ＞という新興宗教団体に遭遇し、その船の主であり、教団の指導者である“マスター”ことランカスター・ドッドに迎えられる。そこからフレディの人生は180度変わる。マスターはあるメソッドで悩める人々の心を解放し、カリスマ的な人気を得ていた指導者だった。フレディは次第にその右腕として地位を得ていくが、その陰にはマスターの妻が潜んでいた―。そして3人の関係は次第に力の均衡を崩しはじめ、教団をも壊そうとするのだった。

2012年9月に開催された第69回ヴェネチア国際映画祭で最大の話題作となった『ザ・マスター』。『ゼア・ウィル・ビー・ブラッド』などで知られるポール・トーマス・アンダーソン監督の5年ぶりの新作、ホアキン・フェニックスの俳優復帰作（長編オリジナルとして）、そして新興宗教団体（サイエントロジー）にインスパイアされたと取沙汰されるストーリーなど、話題性は段違いだった。
だが、そんな世間を騒がせる刺激的なテーマとは全く違う形で、同映画祭の公式上映後は絶賛の嵐となった。重厚かつ、無駄がそぎ落とされた演出、3人の役者の凄まじい演技力により、監督賞にあたる銀熊賞、そしてホアキン・フェニックスとフィリップ・シーモア・ホフマン両名に最優秀主演男優賞がもたらされたのだ。これまでのＰＴＡ監督作品の中でも最強かつ最高のドラマであり、本年度のアカデミー賞に最も近いと称されるこの衝撃作が、ついに日本で公開となる。